小燕子和林羽凡商量后，决定先从皇后的心腹太监入手。他们暗中跟踪这个太监，发现他经常与宫外的一个神秘人接头。经过一番调查，得知这个神秘人是皇后娘家的远房亲戚，一首为皇后在宫外传递消息、谋划事情。
林羽凡安排了几个可靠的人手，在一次太监与神秘人接头时，将他们一举抓获。经过审问，两人交代了皇后的一些恶行，包括之前陷害永琪的阴谋，以及这次设陷阱陷害小燕子的计划。但这些证据还不足以让乾隆下定决心废后，毕竟皇后家族在朝中也有一定势力。
小燕子心急如焚，她觉得不能再坐以待毙。这时，她突然想起了晴儿。晴儿在宫中多年，对后宫之事了如指掌，或许能提供一些关键线索。于是，小燕子找到晴儿，将目前的情况详细告知。
晴儿听后，眉头紧锁，沉思片刻后说道：“小燕子，我想起一件事。曾经皇后在处理一位宫女的事情上手段狠辣，那个宫女不堪折磨自尽了。当时这件事被皇后压了下来，但我恰好知道有个老嬷嬷知晓内情，或许她能提供有力证据。”
小燕子大喜，赶忙与晴儿一起去找那位老嬷嬷。老嬷嬷起初害怕皇后报复，不敢开口。在小燕子和晴儿的再三劝说下，老嬷嬷终于鼓起勇气，讲述了当年的事情经过，并拿出了宫女留下的一封遗书，上面详细记录了皇后的恶行。
与此同时，永琪在朝堂上也在努力。他联合几位大臣，向乾隆呈上了皇后在朝中结党营私、干预朝政的证据。乾隆看到这些证据后，龙颜大怒，但仍有所顾虑，毕竟废后是一件关乎国本的大事。
皇后察觉到自己的恶行逐渐败露，心中又惊又怒。她决定破釜沉舟，打算在乾隆面前反咬一口，诬陷小燕子、永琪和林羽凡等人结党谋反。她精心策划了一场阴谋，安排人手在小燕子和永琪的府上偷偷藏入一些谋反的信件，准备找机会向乾隆告发。
就在皇后自以为计划天衣无缝时，小燕子等人却提前得知了消息。原来，皇后身边有个小太监，一首对皇后的所作所为不满，听闻皇后的阴谋后，偷偷向小燕子通风报信。
小燕子、林羽凡和永琪得知消息后，决定将计就计。他们一方面将计谋反信件换成了皇后恶行的证据，另一方面安排人在暗中监视皇后的一举一动。
当皇后觉得时机成熟，带着人闯入小燕子和永琪的府上搜查时，她自信满满地以为能抓住他们谋反的把柄。然而，当她打开藏信的盒子，看到里面的内容时，顿时脸色惨白。
“这……这怎么可能！”皇后惊恐地叫道。还没等她反应过来，乾隆在小燕子等人的引导下，突然来到现场。
乾隆看着盒子里的证据，怒不可遏。“皇后，你还有何话可说！”皇后瘫倒在地，知道大势己去，却仍妄图狡辩。“皇上，这都是他们陷害臣妾的，臣妾冤枉啊！”
乾隆冷哼一声，“证据确凿，你还敢狡辩！你身为皇后，不思母仪天下，却做出如此多的恶行，实在让朕失望透顶！”
最终，乾隆下令废除皇后之位，将她打入冷宫。皇后的党羽也纷纷受到牵连，被一一处置。小燕子、林羽凡和永琪成功地揭露了皇后的真面目，皇宫内的阴霾终于散去。
经过这场风波，小燕子更加珍惜现在的生活。她将更多的精力放在教导儿子林睿上，希望他能成长为一个正首善良的人。林羽凡在朝堂上的地位也更加稳固，成为乾隆身边不可或缺的大臣。永琪经过此次事件，在乾隆心中的地位愈发重要，为日后继承大统奠定了坚实的基础。
而皇宫内，经过这次整顿，风气焕然一新。各位妃子和皇子们都吸取了教训，更加注重自身品德修养。老佛爷对小燕子等人的做法也赞赏有加，时常在众人面前夸赞小燕子的聪慧和勇敢。
在这个充满故事的皇宫里，新的生活画卷正缓缓展开，每个人都在自己的位置上，书写着属于他们的美好篇章，而小燕子的传奇故事，也成为了皇宫中人们口中永远的佳话，激励着一代又一代的人坚守正义，勇敢面对生活中的挑战……
